OLIGOS LNA

Oligos LNA são produzidos com ácido nucleico análogo que contém uma ponte de metileno 2′-O, 4′-C.

A ligação em ponte fixa o anel pentose na conformação 3′-endo. Na verdade, os nucleotídeos do LNA são blocos de construção de RNA devido ao 2´oxigênio no componente de açúcar no local, porém não requer um grupo de proteção 2´OH (como TBDMS, TOM, ACE ou TC), pois “o bloqueio” fornece proteção.

A construção de oligos com LNA em primers para PCR, sondas qPCR e outros tipos de oligonucleotídeos fornecem “oligo-solubilidade” em água e tampões padrão. E como a modificação diz respeito apenas à estrutura do ácido nucléico, as regras de emparelhamento de bases de Watson-Crick permanecem inalteradas.

Vantagens:

• Eficiencia na detecção de  SNPs
• Valores de Ct menores
• Melhor intensidade de sinal com menor ruido
• Designs facilitados e flexíveis para sequências alvo problemáticas – porém dependentes da sequência.

Aplicações:

• PCR/real-time PCR/RT-PCR
• Microarrays/Capture probing
• Gene silencing
• In Situ Hybridization (ISH)